CDC对“的响应;与瘟疫无关写论文“:12月的人到人的感染是根据数据倒算的,论文是在向社会公开信息之后写的-量子比特
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十三郭一璞来自自主隔离的量子比特报道
不管疫情如何,你都忙着交论文吗?
1月29日,中国疾控中心(CDC)在新英格兰医学杂志中发表了《新冠肺炎在中国武汉的早期传播动力学》一文。
该期刊2018年的影响因素为70.670,可以说是医学期刊的最高峰、转压影响因素59.102的《柳叶刀》。
但论文一发表,CDC就受到各界的谴责,很多人早就发现了问题,认为不忙着控制疾病在自己的简历上发表论文。
到了今天早上,在舆论的追赶下,他回应了风口浪尖的中国疾控中心(CDC)
CDC论文中的数据分析后,还没写完论文就已经向社会公布了,但是“12月人传染给人”的判断,根据之后的数据和资料反而被退回了。
也就是说CDC并没有向社会隐瞒疫情。
回答全文如下:。
从这篇发表的论文来看,文章确实很短,不需要太长的写作时间。
此外,从事病毒研究的科学家们也不能直接推动决策部门及早采取严厉措施。
中国疾控中心流行病学首席科学家曾光在接受《环球时报》主编胡锡进采访时表示,武汉此次疫情治理滞后主要是一个科学认识问题,但也不排除一些决策上的犹豫。公共卫生员的决策是一个科学的问题,一个科学的视角,但政府高官思考问题并不是单纯的科学的视角,这只是一个科学的视角
当然,这篇论文也说明了很多重要的问题。请注意,所有的结论都是在1月4日当前的数据中得出的。
1、去年12月已出现人传人现象。
2,测得的R0值为2.2,即平均1名患者感染2.2人。
3、武汉采取了控制措施。其他地方要避免重蹈武汉的覆辙。当然,从我们站在1月底的时候来看,其他地方没有武汉那么严重。
4、疾病发现早,两天内患者就要去医院,但隔离困难,发病5天就能住院。
5、医护人员此次不像SARS和MERS那么悲惨,感染比例稍低的孩子可能感觉不到,症状可能比较轻。
这些问题是怎么发现的?让我们重现整个研究过程。
怎么检测?数据源
最初的病例是根据被称为“病因不明肺炎”的检查机制确定的。
定义为无病因病原体的疾病,满足以下标准。
发热≥38℃;肺炎影像学证据根据白细胞/淋巴细胞计数低的标准临床指南进行抗菌治疗3-5天后症状无改善。
发现肺炎病例后,为提高早期检查灵敏度,于2020年1月3日应用下述病例定义制定监测方案,识别潜在病例。
在发现疑似病例后,现场流行病学联合小组(由中国疾病控制预防中心(中国CDC及省、市和县CDC成员组成)接到通知开始详细现场调查,收集呼吸道标本,然后到位于北京的中国CDC病毒病预防管理所集中检查。
由中国CDC和当地CDC工作人员组成的联合小组对被确诊为2019-nCoV的所有病例进行了详细的现场调查。
通过采访感染者、亲属、密切接触者、医务人员将数据收集到标准化表中,收集关于发病日、就诊日、住院日、临床结果的信息。
研究人员根据需要对感染患者及其亲属进行访谈,确定发病前两个周期内的暴露史。这包括野生动物,特别是被称为武汉华南海鲜批发市场上销售的动物,暴露的日期、时间、频率和模式,以及相关环境,例如华南海鲜批发市场和其他生鲜市场的暴露史。
此外,还收集了与其他类似症状患者的接触信息。现场调查期间收集到的所有流行病学信息(包括暴露史、事件时间线和密切接触者的确定)均与多个来源的信息交叉核查。
对患者发病前2周进行的家庭和地方也进行了调查。
数据在中央数据库中以一式两式输入,并使用EpiData软件(EpiData Association)进行匹配。
病例定义
对于疑似NCIP病例,目前采用的初步病例定义基于2003年和2012年世界卫生组织(WHO)提出的SARS和中东呼吸综合征(SARS)(MERS)病例定义。
NCIP疑似病例的定义是全部符合上述4个标准的肺炎病例,或满足前3个标准且与华南海鲜批发市场存在流行病学关联或与其他类似症状患者接触的肺炎病例。
2020年1月18日,在获得有关确诊病例的新信息后,定义疑似病例的流行病学标准更新:
确诊病例的定义采用以下3种方法中的任一种,从呼吸道检体中检测出2019-nCoV阳性
分离2019-nCoV;实时逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)至少2次显示2019-nCoV阳性;检测与2019-nCoV匹配的基因序列。
实验室检查
2019-nCoV的实验室检测基于先前WHO的建议。
采集患者上、下呼吸道标本。提取RNA,用2019-nCo特异性引物和探针进行实时RT-PCR检测。
检测分别在湖北省CDC和中国CDC病毒病预防管理所生物安全二级实验室进行。
如果两个靶点经特异性实时RT-PCR检测阳性,则视为实验室确诊。循环阈值(Ct值)lt;37定义为阳性,≥40定义为阴性。中等量)Ct值定义为37~lt;40)需复查确诊。如果复查Ct值小于40且观察到明显的峰值,或者复查Ct值小于37,则认为复查结果为阳性。
确诊患者中位年龄59岁,平均潜伏期5.2天
在新冠疫情发展过程中,病例数量呈指数增长,近几天曲线的下降可能是由于近期发病病例未得到充分证实和发病率的真正转折点,而不是病例识别和报告时间的延误。
▽图1:武汉市首例425例新冠肺炎确诊病例的发病情况
具体来说,曲线的后半部分并不是新发病数减少,而是因为截止日期前的病例确认延迟了。
最早的病例大多报告华南海鲜批发市场暴露史,但从12月底开始,与该市场无关的病例数呈指数增长。
患者中位年龄为59岁(范围:15~89岁),425例中240例(56%)为男性。没有15岁以下的孩子。
对3个时间段的病例也进行了分析
第一时间段为1月1日(华南海鲜批发市场关闭日)前发病的患者,第二时间段为1月1日至1月11日(武汉提供RT-PCR试剂日)期间发病的患者,第三时间段为1月12日以后发病的患者。
△表1、截至2020年1月22日,武汉市新冠肺炎患者特征分析
发病早的患者年龄稍轻,男性比例较高,报告华南海鲜批发市场暴露史的比例明显较高。医务人员在病例中所占比例在三个时间段逐渐增加。
对确诊的10例暴露数据进行分析,估计平均潜伏期5.2天(95%置信区间(ci),4.1~7.0);如图2.A所示,分布情况的95个百分比是第12.5天(95%CI,9.2-18、
△图2:事件发生的关键时间分布情况
此外,如图3所示,还得到了5个病例的簇的信息。
从这些病例群中的6对病例的发病日,如图2.B所示,推测为从一个人传给另一个人的平均±SD(间隔时间分布为7.5±3.4天)95%CI、5.3~19)
在截至2020年1月4日的流行曲线中,感染症的增加率为每天0.10(95%CI,0.050~0.16、,倍增时间为7.4天)95%ci,4.2~14、当应用从上述一个人到另一个人的间隔时间分布时,R0估计为2.2(95%ci,1.4-3.9)
在1月1日之前发病的45例患者中,从发病到初次就诊的平均间隔估计为5.8天(95%CI,4.3~7.5、,与1月1日至1月11日期间发病的207例患者的数据相似,后者的平均间隔为4.6天)95%CI,4.1~5.1、图2.C
在截至1月1日发病的44例患者中,从发病到住院的平均间隔期估计为12.5天(95%CI,10.314.8、,该间隔期超过了截至1月1日1月11日发病的189例患者(平均值,9.1天,95%CI,8.69.7、,如图2.D所示。
由于尚未检测到近期发病与发病和就诊间隔较长的患者,因此未描绘1月12日以后发病患者的分布曲线。
◆图3:5个病例簇(包括16例)的详细暴露信息和发病日。数据意味着什么
根据前面的研究,论文的作者们得出了一些重要的结论。
去年12月已经从人到人
有证据表明,自2019年12月中以来,浓厚接触者之间发生了人向人的传播,此后一个月疾病逐渐蔓延。
截至1月4日的数据显示,武汉市约每7.4天肺炎病例数翻一番。
因此,在武汉以外的其他城市,需要做出巨大努力来减少传播,防止新冠肺炎大范围爆发,并采取措施在危险人群中预防或减少传播。
平均一个病人感染2.2人
使用到1月4日为止的数据,研究者们判断该疾病的R0值约为2.2。
R0值,即每名患者感染数人,或每名肺炎患者感染2.2人。
如果R0值大于1,疾病就会蔓延,疾病的预防和控制就是将R0降到1以下。SARS的R0值约为3,之后通过隔离患者和谨慎的感染控制来控制SARS。
控制新兴冠状病毒肺炎的难点在于需要隔离轻症感染者,隔离患者和密切接触者的资源有限。
由于数据一直持续到1月4日,此后武汉民众防疫意识增强,防范措施升级,感染能力下降。
但其他地区和其他国家的病例仍在增加,疾病仍在蔓延。因此,研究者们建议,为了不发生与武汉相同强度的本地传播,有必要明确其他地方是否会重蹈武汉的覆辙。
疾病发现早,隔离难
从这些数据来看,患者发病都就诊之间的间隔通常很短,27%的患者在出现发热症状的两天内到医院就诊。
但是,等待住院的时间非常长,89%的患者必须等待发病第5天才能住院。
这些数据意味着,早期患者识别困难,隔离困难,需要在门诊和急救上投入大量资源进行检查,积极发现病例,这是抑制局部扩散的重要策略。
医疗工作者没有SARS那么惨,孩子可能很难感觉到
在早期病例中,小儿患者相对较少,425例几乎半数为60岁以上的患者,小儿不易感染或感染后症状可能较轻。
在医疗工作者中感染的比例没有SARS和MERS爆发时那么高。
此外,由于早期数据不足,人们认识也不足,调查可能存在局限性。
最后,为了帮助大家对疫情和研究进展做出完整判断,将颜宁教授参加的《归朴》团队整理的时间节点追溯图进行了如下搬运:
大家可以判断研究的时间线和过程。
论文传送门
Early Transmission Dynamics in Wuhan,China,of Novel Coronavirus–Infected Pneumonia链接:https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001316